สำนักข่าวต่างประเทศรายงานว่า เริ่มมีการตั้งข้อสังเกตจากสื่อหลายสำนักรวมถึงผู้เชี่ยวชาญบางส่วนที่เชื่อว่า สาเหตุที่ทำให้เครื่องบินโดยสารสายการบินอาเซอร์ไบจานตกในคาซัคสถาน อาจมาจากถูกระบบป้องกันภัยทางอากาศของรัสเซียยิงโดยไม่ตั้งใจ

ภาพนิ่งและคลิปบางส่วนที่มีการเผยแพร่ผ่านสื่อออนไลน์ตั้งแต่เมื่อวานนี้ เห็นรูหลายรูที่ซากเครื่องบินโดยสารอาเซอร์ไบจานแอร์ไลน์ ที่ตกในคาซัคสถานเมื่อช่วงก่อนเที่ยงวันพุธที่ผ่านมา แหล่งข่าว 4 แหล่งในอาเซอร์ไบจานที่ใกล้ชิดกับการสอบสวนเผยกับสำนักข่าวรอยเตอร์ว่า เครื่องบินถูกยิงตกโดยระบบป้องกันภัยทางอากาศแพนต์เซียร์-เอส (Pantsir-S) ของรัสเซีย ซึ่งเป็นขีปนาวุธจากพื้นสู่อากาศ โดยที่ระบบสื่อสารบนเครื่องบินถูกระบบสงครามอิเล็กทรอนิกส์ของรัสเซียก่อกวนขณะที่กำลังบินไปยังกรุงกรอซนี เมืองหลวงของสาธารณรัฐเชเชนของรัสเซีย ทำให้เครื่องบินตกใกล้เมืองอักเตาของคาซัคสถาน

ขณะที่สื่อในอาเซอร์ไบจานรายงานอ้างแหล่งข่าวจากรัสเซียว่า ระบบป้องกันภัยทางอากาศของรัสเซียพยายามยิงสกัดโดรนพิฆาตของยูเครน ในช่วงเวลาเดียวกับที่เครื่องบินโดยสารอาเซอร์ไบจานบินผ่านเหนือน่านฟ้าสาธารณรัฐเชเชน ขีปนาวุธรัสเซียระเบิดกลางอากาศใกล้กับเครื่องบินลำนี้ และสร้างความเสียหายต่อลำตัวและระบบบางอย่างของเครื่องบิน ช่วงที่เตรียมจะลงจอดยังจุดหมายในกรุงกรอซนี นักบินพยายามนำเครื่องบินลงจอดฉุกเฉินที่สนามบินหลายแห่งในรัสเซีย แต่ทางการรัสเซียไม่อนุญาต ทำให้ต้องบินข้ามทะเลสาบแคสเปียนไปยังคาซัคสถาน รายงานระบุด้วยว่า รัสเซียไม่ได้สั่งปิดน่านฟ้าหรือห้ามเที่ยวบินพลเรือนบินเหนือน่านฟ้าบริเวณดังกล่าว

ก่อนหน้านี้ เจ้าหน้าที่สืบสวนรัสเซียเปิดเผยข้อมูลเบื้องต้นว่า เครื่องบินโดยสารลำนี้น่าจะบินชนฝูงนก จนต้องเปลี่ยนเส้นทางจากกรุงกรอซนีไปยังคาซัคสถาน และตกที่เมืองอักเตาขณะพยายามลงจอดฉุกเฉิน มีผู้เสียชีวิต 38 ราย บาดเจ็บ 29 คน ด้านโฆษกทำเนียบประธานาธิบดีรัสเซียชี้แจงหลังจากมีรายงานข่าวเรื่องเครื่องบินอาจถูกยิงโดยระบบป้องกันภัยทางอากาศของรัสเซียว่า ไม่ควรด่วนสรุปสาเหตุจนกว่าจะมีการตั้งคณะทำงานเพื่อสืบสวนความจริงให้กระจ่าง ขณะที่ประธานาธิบดีอิลฮาม อาลิเยฟ ของอาเซอร์ไบจานได้สั่งตั้งกรรมาธิการขึ้นมาสอบสวนหาสาเหตุของเหตุเครื่องบินตกครั้งนี้แล้ว